MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis str. JB197 chromosome 1

Total Repeats: 19170

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008510	AAAT	2	8	1927	1934	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008510	AGATG	2	10	1945	1954	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008510	ACA	2	6	1992	1997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008510	AT	3	6	2004	2009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008510	AT	3	6	3919	3924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008510	AT	4	8	3937	3944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008510	TAAT	2	8	4011	4018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008510	T	7	7	4041	4047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008510	GA	4	8	4048	4055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008510	A	6	6	4097	4102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008510	TCAT	2	8	4113	4120	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008510	TTGA	2	8	4165	4172	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008510	T	7	7	4231	4237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008510	GGA	2	6	4244	4249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008510	A	6	6	5612	5617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008510	ATT	2	6	5918	5923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008510	A	6	6	5974	5979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008510	TTA	2	6	6206	6211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008510	AAT	2	6	6223	6228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008510	GTT	2	6	6239	6244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008510	GAA	2	6	6312	6317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008510	CAA	2	6	6327	6332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008510	GAT	2	6	6388	6393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008510	TAA	2	6	6427	6432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008510	TAAA	2	8	6458	6465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008510	ATA	2	6	6480	6485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008510	A	8	8	6554	6561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008510	TAC	2	6	6616	6621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008510	TAA	3	9	6635	6643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008510	ATTT	2	8	6646	6653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008510	TAA	2	6	6657	6662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008510	A	6	6	6673	6678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008510	TGA	2	6	9364	9369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008510	ATT	2	6	14829	14834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008510	TCT	2	6	14846	14851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008510	AACG	2	8	14873	14880	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_008510	ATT	2	6	14907	14912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008510	GAA	2	6	14956	14961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008510	A	7	7	14960	14966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008510	A	6	6	15033	15038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008510	AGTC	2	8	15047	15054	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_008510	GAA	2	6	15069	15074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008510	A	6	6	15114	15119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008510	A	6	6	15185	15190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008510	GAT	2	6	15228	15233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008510	CGA	2	6	15247	15252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008510	CTT	2	6	15426	15431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008510	A	7	7	15452	15458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008510	GAA	2	6	15498	15503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008510	A	7	7	15502	15508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008510	A	6	6	15539	15544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008510	GGC	2	6	15545	15550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008510	A	6	6	15642	15647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008510	CTA	2	6	16281	16286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008510	A	6	6	16291	16296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008510	T	6	6	16327	16332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008510	A	7	7	19939	19945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008510	GAA	2	6	19948	19953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008510	TAAAG	2	10	19959	19968	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008510	GAA	2	6	20293	20298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008510	T	6	6	20307	20312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008510	T	8	8	20340	20347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008510	T	6	6	20398	20403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008510	T	6	6	20410	20415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008510	AAT	2	6	20425	20430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008510	CGA	2	6	20456	20461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008510	CAA	2	6	20579	20584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008510	TCC	2	6	20589	20594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_008510	TCT	2	6	20606	20611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008510	ATT	2	6	20624	20629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008510	CGA	3	9	21981	21989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008510	T	6	6	22014	22019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008510	AAG	2	6	24315	24320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008510	CTT	2	6	25482	25487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008510	ACT	2	6	25523	25528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008510	CT	3	6	25527	25532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_008510	T	6	6	25620	25625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008510	A	6	6	25655	25660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008510	CCT	2	6	25678	25683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_008510	GGA	2	6	25727	25732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008510	GATT	2	8	25761	25768	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008510	TAT	2	6	25780	25785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008510	AAG	2	6	25797	25802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008510	CTT	2	6	25862	25867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008510	A	6	6	25969	25974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008510	TTC	2	6	26059	26064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008510	AGA	2	6	26102	26107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008510	ATC	2	6	26115	26120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008510	AAT	2	6	26131	26136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008510	ATAA	2	8	26586	26593	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008510	ACCG	2	8	26620	26627	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008510	A	6	6	26726	26731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008510	AAG	2	6	26833	26838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008510	CAG	2	6	26979	26984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008510	AAAT	2	8	27004	27011	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008510	TTG	2	6	27268	27273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008510	CCCG	2	8	27324	27331	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_008510	ACG	2	6	27515	27520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008510	ACC	2	6	27574	27579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_008510	CAA	2	6	27589	27594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008510	AAG	2	6	27747	27752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008510	TCC	2	6	27757	27762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_008510	TAA	2	6	28066	28071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008510	A	6	6	28080	28085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008510	A	6	6	28137	28142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008510	A	6	6	28144	28149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008510	A	8	8	28153	28160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008510	GAAAA	2	10	28313	28322	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008510	AAC	2	6	28402	28407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008510	TCAAA	2	10	28427	28436	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_008510	TCA	2	6	28441	28446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008510	A	6	6	28446	28451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008510	GAATG	2	10	28461	28470	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008510	TTG	2	6	28478	28483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008510	ATT	2	6	28696	28701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008510	TGA	2	6	28752	28757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008510	TTA	2	6	28763	28768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008510	AAC	2	6	28844	28849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008510	ATT	2	6	28875	28880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008510	AAG	2	6	28899	28904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008510	GA	3	6	28962	28967	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008510	GAG	2	6	28992	28997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008510	GTTC	2	8	29064	29071	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_008510	AAAC	2	8	29123	29130	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008510	TC	3	6	29279	29284	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_008510	CTC	2	6	29328	29333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_008510	TGA	2	6	29337	29342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008510	AG	3	6	29357	29362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008510	GGC	2	6	29380	29385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008510	AAT	2	6	29425	29430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008510	AGA	2	6	29443	29448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008510	AGG	2	6	29459	29464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008510	TTG	2	6	29470	29475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008510	TCG	2	6	29593	29598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008510	ATT	2	6	29624	29629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008510	A	6	6	29639	29644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008510	A	6	6	29651	29656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008510	TAT	2	6	29787	29792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008510	TATG	2	8	29912	29919	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008510	AAAT	2	8	30033	30040	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008510	AT	3	6	30049	30054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008510	TAA	2	6	30065	30070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008510	T	6	6	32204	32209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008510	TTA	2	6	34151	34156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008510	A	6	6	34160	34165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008510	A	6	6	34218	34223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008510	A	7	7	34258	34264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008510	TAA	2	6	34425	34430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008510	TAC	2	6	34472	34477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_008510	ATAAA	2	10	34532	34541	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008510	AAT	2	6	34546	34551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008510	T	7	7	34573	34579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008510	GAA	2	6	34618	34623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_008510	CA	4	8	34728	34735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_008510	TTG	2	6	34740	34745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_008510	AAAAT	2	10	34754	34763	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_008510	TAAA	2	8	34772	34779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_008510	ATT	2	6	34804	34809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_008510	A	6	6	34904	34909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_008510	ATTC	2	8	34915	34922	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
162	NC_008510	A	7	7	34923	34929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_008510	TTC	2	6	34960	34965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_008510	A	7	7	35006	35012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_008510	AAT	2	6	35036	35041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_008510	AAAACT	2	12	35054	35065	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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168	NC_008510	CAT	2	6	35235	35240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_008510	TAT	2	6	35273	35278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_008510	TCA	2	6	35345	35350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_008510	TGAAAA	2	12	35381	35392	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_008510	T	6	6	35526	35531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_008510	GAA	2	6	35665	35670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
182	NC_008510	TGAC	2	8	35925	35932	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
183	NC_008510	GCA	2	6	35935	35940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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186	NC_008510	AAGT	2	8	36128	36135	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
187	NC_008510	TTC	2	6	36275	36280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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193	NC_008510	TC	3	6	36642	36647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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286	NC_008510	TAA	2	6	58859	58864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_008510	GCAAA	2	10	58985	58994	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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